readme.Rmd

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title: "Doc"
output: github_document
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## Intégration/exploration des cartes SDM LECA

### Scripts

- **init_SDMLECA.R** :

accès aux BDs DOE / SIG / SPN
import sources ABDSM
import geometries admin
import taxref / liens photos / liens idGBIF/CDNOM
import tables reference SDMLECA


- **diag_coherence_SDMLECA_TAXREF.R** :

Mise en cohérence de la nomenclature SDM LECA vs TAXREF
cf. coherence_taxref.ppt
sortie des logs erreurs pour investigation
workflow sequentiel (nominal) vs workflow taxref-match

_A envisager : appel taxref-match depuis fonction sql_


- **diag_coherence_SDMLECA_TAXREF_adhoc_amphibiens.R** :

Version adhoc pour corrections incohérences via expert groupe taxo


- **corresp_SDM_maillageINPN.R** :

conversion rasters SDMLECA à la maille INPI 1km, avec nomenclature taxref
export df sous format csv : cd_sig / val_mod_binary / val_mod_constrained / val_mod_suitability / cdnom
et fichier intégral des données espèces sous format parquet

_A envisager : traitement duckdb optimisé ?_


- **valo_croisement_ABDSM_SDMLECA.R** :

formatage stats ABDSM
sorties carto departementales pour croisement SDMLECA/ABDSM
sortie graphique synthese sur cohérence SDMLECA/ABDSM



- **check_contenu_raster.R**

vérification des valeurs prises par la sortie 'binary'